万方查重率是指万方数据库中文献查重系统的查重结果，主要用于检测学术论文的原创性。与知网查重率相比，万方查重率更注重学术领域的查重需求，覆盖了更多学术文献资源，具有更高的准确性和可靠性。同时，万方查重率还提供了更多的查重报告细节，帮助用户更好地了解文献的重复程度。

知网查重率则是知网文献查重系统的查重结果，主要应用于科研机构和学术期刊的文献查重工作。相较于万方查重率，知网查重率在工程技术领域的文献覆盖更广，对外文文献的查重效果也更好。此外，知网查重率还支持多种文献格式的查重，包括英文论文、会议论文等，适用范围更广泛。