学校知网查重是指利用学校购买的知网系统进行查重操作，主要用于学术论文、毕业论文等文献的查重工作。知网查重通常具有较高的准确性和权威性，能够检测出文献中的抄袭和重复内容。而软件查重则是指使用专门的查重软件进行文本比对，常见的软件包括Turnitin、Copyscape等。软件查重相对灵活，适用于各种文本类型的查重需求。总的来说，学校知网查重更注重学术规范和权威性，而软件查重更注重操作便捷和适用范围广泛。

另外，学校知网查重通常需要学校购买并提供账号权限，只能在特定平台上进行查重操作，受到使用范围的限制。而软件查重则可以在个人电脑上安装相应软件，自主进行查重，灵活性更高。此外，学校知网查重可能会有一定的查重次数限制，需要注意使用频次。而软件查重一般按照购买的套餐或订阅方式提供服务，使用次数和次数限制相对更加灵活。综上所述，选择学校知网查重还是软件查重取决于您的具体需求和使用场景。